簡介：
常規(guī)我們是以基因為單位，來篩選組間差異表達(dá)的基因。基因集差異分析是以基因群體為單位（比如一個GO分類或者pathway）, 計算基因集群在組間的差異性。該計算有多種方式，比如GSEA。以下以GSEA 為例。GSEA是將基因集中的基因按照在實驗組與對照組樣本中的差異表達(dá)賦予不同的權(quán)重，然后檢驗設(shè)定的基因集的基因表達(dá)變化對某一個基因集（功能或通路等）的影響是否具有顯著性意義。
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解讀：
圖中顯示的是 GSEA 分析基因集后得到的 EnrichScore值分布。圖上部的曲線表示動態(tài) ES 值，最高點表示此基因集的 ES 值。
分析關(guān)鍵：
1）不同計算方式基于的原理不一樣，計算結(jié)果也有所不同，如何結(jié)合使用。
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